МОУ "Рудногорская СОШ" имеет следующую структуру управления:
1. Единоличным исполнительным органом МОУ "Рудногорская СОШ" является директор, который осуществляет текущее руководство деятельностью школы.
2. В школе формируются коллегиальные органы управления, к которым относятся:
1) Общее собрание работников (Положение)
2) Педагогический совет (Положение)
3) Управляющий совет (Положение)
МОУ "Рудногорская СОШ" не имеет структурных подразделений.